Pada pagi Sabtu, suhu mencapai 31 derajat Celcius, menciptakan tantangan bagi para pembalap. Sesi yang singkat membuat semua peserta segera keluar ke lintasan saat pit lane terbuka. Sam Lowes kembali memimpin di awal sesi, sementara Nicolo Bulega dari Ducati berada di urutan kedua. Namun, keunggulan mereka tidak bertahan lama, karena Iker Lecuona dan Toprak Razgatlioglu juga masuk dalam persaingan. Bulega berhasil menyalip Razgatlioglu setelah delapan menit berlalu. Pada paruh pertama, 10 besar diisi oleh Bulega, Razgatlioglu, Lecuona, Sam Lowes, dan pembalap lainnya.
Perubahan terjadi dalam lima menit terakhir, saat Danilo Petrucci menjadi pembalap tercepat, diikuti oleh Razgatlioglu. Meskipun sempat hampir jatuh, Sam Lowes berhasil mempertahankan posisinya hingga akhir. Yamaha juga menunjukkan performa yang baik di Balaton Park dengan empat pembalap mereka masuk dalam 10 besar. Razgatlioglu tidak berhasil bangkit dari posisi kedua, sementara Petrucci, Lecuona, Bulega, dan pembalap rookie Ryan Vickers melengkapi 10 besar.
